O Projeto Baleia Jubarte nasceu em 1988, durante os trabalhos de implantação do Parque Nacional Marinho dos Abrolhos, com a finalidade de promover a proteção e pesquisa das baleias-jubarte no Brasil. Em 1996, deu origem ao Instituto Baleia Jubarte, organização não-governamental que possui como missão conservar as baleias-jubarte e outros cetáceos do Brasil, contribuindo para harmonizar a atividade humana com a preservação do patrimônio natural.